Фонд Ельцина продолжает сотрудничество с Фондом «Демократия», учрежденным А. Н. Яковлевым. В 2008-2009 гг. при поддержке Фонда Ельцина были изданы три новых сборника документов из архивов Фонда «Демократия».
В сборнике «Военная разведка информирует» приводятся документы советской военной разведки с января 1939 по июнь 1941 г., многие из которых вводятся в научный оборот впервые. Публикуемые материалы дают достаточно полное представление о деятельности Разведуправления Генштаба Красной Армии в указанный период. Они показывают роль военной разведки в информировании советского руководства об агрессивных планах гитлеровской Германии и ее союзников и дают возможность понять сложнейшие события и проблемы того времени, в частности, почему стали возможны трагические события начального периода Великой Отечественной войны.
В книгу «Александр Яковлев. Перестройка 1985-1991 гг. Неизданное. Малоизвестное. Забытое.» вошли ранее не издававшиеся, малоизвестные и во многом забытые документы, связанные с деятельностью выдающегося советского и российского политического деятеля и политического мыслителя Александра Николаевича Яковлева – «архитектора» перестройки и страстного защитника свободы личности и принципов свободного, правового и демократического общества. Документы показывают эволюцию взглядов А. Н. Яковлева в переломный для страны период 1985–1991 гг. и являются уникальным источником информации для историков и политологов. Сборник предназначен для специалистов и более широкой читательской аудитории, интересующейся новейшей историей СССР и России.
В сборнике «Аппарат НКВД-МГБ в Германии. 1945-1953 гг.» представлены документы отражающие историю создания и деятельности органов госбезопасности СССР на территории советской зоны оккупации Германии в период 1945–1953 гг. Оперативные группы НКВД, Аппарат Уполномоченного НКВД и пришедший ему на смену аппарат Уполномоченного МГБ СССР в Германии проводили широкие репрессии против немецкого населения обеспечивая Сталину построение «социалистического государства на немецкой земле». Книга предназначена для историков и специалистов в области новейшей истории, а также для всех, кто интересуется российско-германскими отношениями и историей советских репрессий.